金华市农业科学研究院的前身为始建于1958年的金华专署科学研究所。1959年8月单独建制，系全省最早的四个地（市）级农科所之一。1985年10月，金华撤地建市后，更名为金华市农业科学研究所。2004年6月，更名为金华市农业科学研究院。
　　50年来，金华市农科院锐意进取，开拓创新，不断发展壮大。目前院内设党政办公室、科研与成果管理处、农业科技信息中心（市农技110）、作物研究所、蔬菜研究所、果树研究所、畜牧兽医研究所、植物保护研究所、花卉苗木研究所及试验农场，兼管金华市婺南农业高新园区。下辖现代农业新品种引种示范基地（金华桥儿头）、现代农业科技示范基地（婺南农高园区）、海南陵水南繁基地等三个试验、示范和育种基地，总面积达1106亩。全院现有在职职工65人，其中具有高级专业技术职称16人、中级职称17人，享受国务院津贴1人，金华市专业技术拔尖人才3人，金华市首席农业专家2人，浙江省“151工程”人才2人。金华市农业科学研究院已成为一所科研力量较雄厚、具有一定学科优势和特色的地区性综合农业科学研究机构，正引领和支撑着金华现代农业的发展。
　　50年来，金华市农科院紧紧围绕现代农业发展趋势，着眼于金华主导产业，真抓实干，抓科研，促转化，不断创新，大批科技成果脱颖而出。截至目前，全院自主选育成功水稻、小麦、南瓜、西瓜、茭白等新品种22个，获得省（部）、市级科学技术、农业丰收奖项108项。同时，金华市农科院非常注重发挥科技服务功能，创新服务方式，通过广泛开展技术培训与咨询服务，下派科技特派员，联基地联大户活动和院企（地）合作等方式，加快成果转化，使得大批科研成果得到推广应用，产生了巨大的社会经济效益，有力地推动了金华市高效生态农业的发展。
　　展望未来，金华市农科院的农业科技工作将进一步引领和支撑金华现代农业的发展，为农业产业的转型升级作出更大贡献。
院长：郑寨生书记：陈启银